近亲繁殖虽然能快速增加人口，但会带来一系列遗传问题。游戏设定中明确禁止近亲结合，如果尝试让有血缘关系的居民配对，对话中会出现nothing或with family的提示，系统会阻止这种行为。近亲繁殖可能导致后代属性下降，甚至出现无法工作的缺陷居民，影响避难所整体效率。
从管理角度看，近亲繁殖会让居民关系混乱，增加后期调配难度。如果避难所内血缘关系过于复杂，可能遇到居民无法配对的情况，导致人口增长停滞。建议单独安排无血缘关系的男女在起居室配对，避免将兄弟姐妹或父母子女放在同一房间。广播站招募新居民是更稳定的扩员方式，虽然需要时间，但能保证基因多样性。
怀孕的居民需要3小时生产，期间虽能工作但无法应对突发事件，若避难所防御薄弱，可能因人手不足引发连锁危机。孩子成长又需3小时，六小时才能获得一个劳动力，若基因缺陷导致属性低下，反而浪费训练资源。合理规划居民配对和房间布局，比盲目追求人口数量更重要。
长期来看，近亲繁殖会降低避难所应对灾害的能力。属性均衡的居民能更快处理火灾或虫害，而缺陷居民可能拖慢救援进度。训练室可以弥补个体属性不足，但需要额外投入时间。如果前期因近亲繁殖积压大量低效居民，中后期改造会非常麻烦，可能需要重建整个居住区。
与其冒险尝试，不如专注提升现有居民的属性，或通过广播站吸引优质新人。保持基因多样性不仅能优化避难所运营，也能让管理过程更轻松。
