武魂殿与星罗帝国的对立源于政治立场与资源争夺的根本矛盾。武魂殿作为魂师界的绝对权威，长期垄断武魂觉醒与魂师培养体系，并通过经济与军事手段扩张影响力，试图建立以魂师为核心的统治秩序。而星罗帝国凭借军事集权与商业联盟（如七宝琉璃宗）的支撑，形成了独立于武魂殿的魂师培养体系，双方在魂兽资源、领土控制及意识形态上的冲突无法调和。
从游戏机制来看，武魂殿与星罗的对抗体现在阵营选择与资源分配上。玩家加入武魂殿后将获得稳定的魂环补给与高阶魂师指导，但需服从阵营任务限制；选择星罗阵营则能通过商业网络快速积累金魂币，并解锁特殊魂兽狩猎权。这种设计还原了原著中星罗通过经济制裁对抗武魂殿的策略，例如切断武魂殿分殿的物资供应，或联合七宝琉璃宗垄断魂骨交易市场。
武魂殿的宗教属性进一步加剧了与世俗政权星罗的矛盾。游戏中武魂殿通过天使神信仰强化魂师忠诚度，而星罗帝国则以军事荣誉体系吸引玩家，双方在剧情任务中常触发信仰冲突事件。例如星罗阵营任务要求摧毁武魂殿的信仰雕像，而武魂殿方则需保护神像并净化异端。这种设计突出了原著中千道流与星罗皇室关于神权与王权孰高孰低的争端。
在实战玩法上，两大阵营的魂师培养路线差异显著。武魂殿偏向群体增益与神赐魂环的稳定成长，适合长期发展；星罗阵营则强调爆发输出与魂兽协同作战，依赖战术灵活性。玩家需根据自身资源储备选择阵营——若倾向速成战力可优先星罗，追求后期上限则推荐武魂殿。跨阵营合作虽被系统禁止，但部分隐藏任务允许玩家以间谍身份渗透对方阵营获取特殊奖励。
终极冲突体现在帝国争霸玩法中，武魂殿与星罗需争夺关键地图邪神森林的控制权。该区域产出稀有魂兽暗魔邪神虎，其魂环能无视阵营限制提升属性。这一设计巧妙呼应了原著中古月娜缺席导致双方势力失衡的剧情，也为玩家提供了打破阵营壁垒的战略机会。获胜方将解锁专属剧情线，例如武魂殿胜利可触发建立武魂帝国任务，而星罗方则开启大联盟反攻章节。
玩家需权衡短期收益与长期规划，在阵营对抗中寻找个人成长的最优解。这种设计既保留了原著的核心冲突，又为策略选择提供了丰富的可能性。
